《我们都是小绿人》的主题还是围绕小绿人。它是《追踪小绿人》和《又见小绿人》的续集，主人公仍是小叶子。不过，这次多了几个主角，他们是小叶子的同学、乐校长以及小叶子的小叔。
学校里要选出5名志愿者去勘察地形，选好新校址，这5名志愿者是：小叶子、向蓝天、林白雪、万晓辉和张大可。当然乐校长和顾问（小叶子的爷爷）。
这些人在勘察时，遇到了小绿人，包括小晓。因为小晓和小绿人是小绿人，他们可以飞，所以去观察这里的一花一草，一山一水，小叶子也想变成小绿人，就在他努力奔跑追逐他们时，在不知不觉中，也变成了小绿人。受小叶子影响，乐校长，还有那几个同学都被有方向、有目标的力量所感染变成小绿人。只剩下小叔了。小叔以前利用小绿人做过坏事，但小叔现在是诚心悔改了，愿意用生命保护小绿人，所以，小叔最后也变成了小绿人了。所有人都变成小绿人了，这样真好！
在小绿人眼中，世界是美好的，因为它们心地善良，天真无邪。在困难时愿意帮别人一把。只要我们手拉手，和谐相处，我们的世界也会像小绿人的世界那样，美好、和谐！