当小智醒来时，他到了一个不认识的地方，那里有山有水也有房子，非常美丽，可是在远方隐隐约约看得到有些地方不知被什么东西破坏了，看得到一丝荒凉，这时，皮卡丘对他说：“这里就是我们的世界，是不是很漂亮？但如果四大天王再这样破坏下去，这里很快就会变成一片废墟。”
小智问：“那四大天王到底有什么目的？”皮卡丘回答：“大木博士曾经和他们是同事，当时大木博士就想完成一个有所有宠物小精灵的图鉴，但他们都说是不可能的，所以大木博士后来离开了他们，自己工作了。四大天王的目的就是破坏所有的东西和人，只留下宠物小精灵和一些优秀的训练师。”
博士又走出来说：“小智，现在你根本打不过四大天王，你必须到这里的地方修行，你现在就向橘子联盟进发，打败八个训练馆头领，然后到四大天王那里打败他吧，我的孙子小茂是成都联盟的第八个道馆的头领，还有和小茂同行的一位很优秀的训练师他的名字和你一样，也叫小智，他则在白金山修行，你一定要打败他们啊！”
当小智知道了自己的目的后，博士又给了他五个精灵球，说他们可以收服宠物小精灵，只要向它们扔去，就可以了。当小智知道了自己的目的后，也很想完成这个使命，他就从他所在的城市：风雪城出发了。