主要原因：
1、花菜在生长过程中可能因为雨水多或肥料不足感染黑斑病，黑斑病为贮藏中的主要病害，最初使花芽脱色，随后变黑。
2、花菜在保存的过程中会感染上甘蓝链格孢菌，引起变质出现小黑点，即我们平时所说的发霉。
保存方法：
1、常温保存，将花菜放在低温、避光、通风的环境中，能延长花菜的保质时间，环境良好的情况下可以保存一个星期。
2、低温保存，用保鲜膜将花菜包起来放进冰箱的保鲜层是最佳的保存办法，但不要放冷冻室中，温度太低会将花菜冻坏。
在常温下，花菜一般能保存3到5天，用薄膜袋包装低温保存的情况下，有实验证明可以保存长达两个月，但家庭的保存环境温度和材料达不到实验室标准，而且花菜从采摘到售卖也会有一段运送和保存的时间，所以即使低温保存了也在10天以内食用为佳。