从前，有个宇航员驾驶着他的宇宙飞船在宇宙飞行。突然间，被一个巨大的黑洞吸了进去，来到了一个新的宇宙世界。
宇航员被一个声音叫醒，他扭头一看，原来是博士派特叫他去实验室领取属于自已的赛尔精灵。宇航员来到实验室，博士给出三个精灵分别是：草系的布布种子，火系的小火猴和水系的伊优。这三个精灵虽然相生相克，不过有时也在一起用团结的力量打倒敌人。宇航员想了想，最终选中了伊优。
宇航员一天无意中发现每个星球都有守卫神兽，它们分别是：克洛斯星的蘑菇怪，海洋星的钢牙鲨，火山星的里奥斯，塞西利亚星的阿克希亚，云霄星的提亚斯，赫尔卡星的雷伊，双子阿尔法星的纳多雷，双子贝塔星的雷纳多和拜伦号的尤纳斯。宇航员把宇宙飞船修好已后回到地球把同伴叫来，宇航员带领他们用不怕敌人的精神和团结的力量打败了敌人。统令了赛尔世界。
因为有了他们，才有我们现在玩的赛尔号！