1、来源不同。白瓜子其实是一些不同品种的瓜子经过加工制作而成的，所以，白瓜子可以是用西葫芦里面的子制作出来的，也可以是用窝瓜或者南瓜里面的子制作而成的。而南瓜子，其来源很简单，它就是用成熟的南瓜里面的子经过晒干之后制作而成。
2、成熟的时节不同。白瓜子的来源有多种多样，而这些瓜的成熟时节大多数是在夏天，所以，夏天是白瓜子大量上市的时节。而南瓜子本身就是南瓜里面的子，南瓜一般要到秋天才会成熟，所以，南瓜子的成熟时节是在秋天。从这一点，就可以将南瓜子和白瓜子区别开来。
3、外边颜色的不同。这是南瓜子和白瓜子最大的区别，且一眼就能够看出来。白瓜子，顾名思义，其外表颜色是白色的，而南瓜子多为暗黄色。所以，我们在购买瓜子的时候，其实，很容易就能够将南瓜子和白瓜子区分出来，然后，再根据自己的喜好来购买。
4、产地不同。白瓜子一边产自内蒙，是内蒙的土特产品。内蒙的白瓜子体积较大，里面的仁也很大，吃起来特别香甜，现在英国、奥地利等国家的居民都非常喜欢吃白瓜子。南瓜子主要是产自山东、河北、江西等地，因为这些省份地区的南瓜产量较大，所以，南瓜子的产量也非常丰盛。