区别：
1、定义：就业协议是大学生和用人单位在签订劳动合同前，双方确定就业意向和权益的依据。劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。
2、法律依据：就业协议是由教育部高校学生司统一制定的，为高校应届毕业生在就业过程中签订就业协议的一种书面合同。劳动合同是依据劳动合同法。
3、目的不同：就业协议主要体现毕业生情况和意见、用人单位情况和意见及学校意见。劳动合同是指劳动者同企业、事业等用人单位确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。
4、时效不同：就业协议其协议约定仅指学生在毕业后到用人单位去工作的一份书面合同。劳动合同对双方当事人具有法律约束力。
5、签发部门：毕业生就业协议书的签证部门是各级县、市人事调配部门。劳动合同的签证机关是各级劳动行政部门。
6、就业协议仅仅是确立了毕业生和用人单位之间劳动关系，劳动合同更进一步确立了双方的权利和义务。