主要区别为：运行目的不同、运行里程不同、发车密度不同、行车速度不同。
1、运行目的不同：城际列车是指往返于相邻重要城市或城市群之间的客运列车；而高铁运行是途径多个城市的客运列车。
2、运行里程不同：城际列车一般全程运行距离较近、乘车时间较短、途径城市较少；而高铁的运行距离较远，到较远城市乘车时间长，途径城市多。
3、发车密度不同：城际列车为了满足行车需要，城际列车的发车密度、班次总量都相对于高铁更密集，班次更多。
4、行车速度不同：城际列车行车速度均要视车站总数、客流需求、出行目的以及铁路运能等一系列实际情况而定。而高铁的运行速度比乘机列车快，可达350公里每小时。