第一，牙发黄可能是外源性因素导致的：而日常饮食如喝茶、饮咖啡、吸烟等都会在我们的牙齿上留下色素，这些色素吸附在细菌分泌的黏性物质上，逐步使牙齿表面变黄或发黑。日积月累，这些物质还会从牙齿表面逐渐侵入牙齿内部，形成内部污渍，使牙齿内部也慢慢变色。
第二，牙发黄有可能是内源性因素引起的：在牙色发育过程中产生了着色，除了遗传因素外，最常见但也往往被忽略的是由于年龄的增长引起的牙齿变黄。
第三，牙发黄可能是水质的因素导致的：有些地区，特别是有些山区，由于水中含氟量高，过多的饮用氟牙齿会发黄，形成氟斑牙。