1、电影《双瞳》主要讲述了固执的台湾警探与美国FBI专家联手追捕离奇连环杀人案幕后真凶的故事。
2、台北，热闹繁华的都会大城，现代高科技生活与华人几千年的传统信念并存。在这个冷漠异境的城市里，人们相信鬼魂就像是高楼大厦般真实可及。城市车水马龙、人群往来穿梭，一个身心受创的警官正和不知名的神秘恶魔搏斗，受威胁的不只是他的性命，还包括他的灵魂。
3、警官黄火土（梁家辉饰）的世界正逐渐四分五裂。两年前由于揭发同僚贪污，黄火土被打入冷宫，被安排在冷门的外事组工作，他的同事对他怒言相向，他的妻子清芳（刘若英饰）受不了他长期不回家而要求离婚。
4、就在此刻，三宗离奇的命案却使整个警局 天摇地动 。三名受害者的身分彼此没有关联，但是前来验尸的法医（杨贵媚饰）却在三名死者脑部共同发现一种神秘的黑霉菌，而且三人都是在历经幻觉的状态下死亡。
5、显然这是连续杀人犯所为，且为台湾历史上的头一遭。负责侦办的警局又缺乏这方面的专才，在社会人心惶惶的氛围下，高层只好求助于美国。美国联邦调查局派了一名专门侦办此种案例的专家凯文·莱特（大卫·摩斯）前来协助。
6、既然有外国人的参与，黄火土就有事做了，虽然他发现自己处于一种极不讨好的位置。他以前的办案伙伴李丰博（戴立忍饰）警告他如果他帮那美国人破案的话，会使得整个警局再度蒙羞，后果会如何恐怕就不只是打入冷宫而已。
7、但是黄火土身为一名警探的直觉却强过于他的政治判断，他和莱特很快上手此案，也因此使得案情大有进展。
8、然后令人震惊的发现产生了。他们发现凶手是按照一种古老罕见的道教图示来杀人，藉由将作恶的人送入五种残忍恐怖的地狱受刑，来达到长生不老的目的，这同时也预示了将会有更多的受害者出现。对黄火土而言，这似乎暗示著冥冥之中有股超自然的力量在操控一切，但是对于重视实用科学的莱特来说则无法苟同。
9、到底他们寻找的是个邪恶的连续杀人犯还是一个索命的鬼魂。当另一个血腥证据又出现时，他们似乎不得不同时接受两种假设的可能性。