第一，长期使用排卵药是会加速更年期到来，这是因为卵泡的数量有限，长期促使卵泡加速发育成熟，势必导致青春期时储备的4万多个卵泡迅速消耗。当所有卵泡都耗尽之后，由于雌激素不再分泌，更年期就来到了。
第二，长期使用排卵药是会导致雌激素水平过高，这是由于促排卵药阻断了雌激素对下丘脑的反馈，导致身体停留在一个高雌激素水平上，有可能造成卵巢过度刺激综合征——内分泌紊乱、水电解质失衡、盆腹腔积液甚至是血栓。高水平的雌激素还会加速乳腺肿瘤、卵巢囊肿的生长。
第三，长期使用排卵药是会引起其他并发症滥用排卵药导致疾病上身，正常人若服用促排卵药，排卵突然增多，正常人体是很难承受这种变化的，从而还会引发其他并发症的出现，如卵巢囊肿、卵巢破裂、栓塞、电解质紊乱、卵巢过度刺激综合症等，给孕妇带来肝、肾功能衰竭、胸腹水等后果，严重的甚至会导致截肢、休克。