第一：药物的用量也有所不同：人参健脾丸重用黄芪、山药，意在健脾益气;人参归脾丸重用当归、人参养血益气。以上药房的不同决定上述两药的功用也不同：人参健脾丸健脾益气，和胃止泻。所以两者不能相混淆。
第二：两者虽然有区别，但并不冲突，可以一起服用，但服用二者最好相隔半个小时。无论服用人参健脾丸还是人参归脾丸，均应在医生指导下对症用药，不可随意滥服，以免并发他症。
第三：不过这种药物吃多了也会产生副作用，口干。感觉口中津液不足，但没有饮水要求，或饮水很少的表现。鼻燥。鼻腔干燥。多因燥热伤肺，肺经热盛或胃热炽盛所致，亦有肺气虚而鼻干者。