1、饮用水供应系统被破坏，常在灾害后早期引起大规模的肠道传染病的爆发和流行；
2、食物短缺，当规模较大，涉及地域广阔的自然灾害发生时，基本生活条件的破坏，人们被迫在恶劣条件下储存食品，很容易造成食品的霉变和腐败，从而造成食物中毒以及食源性肠道传染病流行；
3、燃料短缺，燃料短缺首先是迫使灾民喝生水，进食生冷食物，从而导致肠道污染病的发生与蔓延，燃料短缺可能造成居民个人卫生水平的下降，可能导致一些本来已处于控制状态的传染病重新流行；
4、水体污染，洪水往往造成水体的污染，如血吸虫病，钩端螺旋体病等，洪水灾害后，在内涝区域留下许多小的水体，如果这些小的水体遭到污染，则极易造成这类疾病的爆发和流行。