若把公司理解为商业环节的公司，工厂理解为工业环节。
1、两者税种不尽相同:
工业环节缴纳的主要税种有增值税、消费税和企业所得税，而商业环节一般只有增值税和企业所得税，消费税仅限于金银首饰零售环节缴纳。
2、两者税负率不尽相同:
相对而言，工业环节增值率高些，税负率也相应高些。当然，也不排除少数行业工业和商业利润倒挂的现象，最突出的就是服装行业，商业环节赚取的利润比工业环节要大。
3、两者纳税环节不尽相同:
工业在移送和销售环节纳税，而商业一般只在销售环节纳税。
4、两者的税收贡献率不尽相同:
总体上说，工业环节税收贡献率大于商业环节。