在农村自建房的时候也会发房产证，只是农村的房产证和市区购买房子的房产证有区别，一般农村是以户为主，不是以个人为主，在填写名字的时候只填写户主的名字。
自建房办理的步骤：
1、申请宅基地的使用权，向当地的房管局申请就可以。
2、需要施工验收以及房屋面积测绘等报告材料。会有专业的人员到现场勘查，然后再填写资料。
3、在审批成为合格的房屋后，可以办理房屋的产权证。
自建房在办理房产证的时候要提前准备好相应的手续，比如个人的身份证明以及房屋审批的证明等，在上交之后，大概审查一个月左右的时间就可以办理。不过在办理之前可以提前了解一下相关的情况。