人类同其他动物一样，也存在着异色瞳。异色瞳的产生原因如下：
虹膜的颜色是一种多基因遗传，不同的人种，颜色差别很大。中国人眼睛的褐色是最常见的，有大量的黑色素。人们常说白种人金发碧眼，白种人眼睛看起来是蓝色。但其实不管看起来是蓝色还是褐色，都是因为黑色素这一种染料”，虹膜后部及基质内有着高浓度黑色素的时，看起来就是褐色。当虹膜后部黑色素浓度正常，但基质内黑色素很低时，大部分光会被反射，只有少部分光会被吸收，看起来就是蓝色，灰色眼睛的原理也一样，但因为大量胶原沉淀使得光发生了不同类型的散射，所以看起来是灰色。
还有绿色眼睛，费雯丽就长了一双迷人的绿眼睛，绿色眼睛虹膜后部黑色素较少，但基质内有一些脂褐素和少量黑色素，所以看起来是绿色。我们还见过琥珀色的眼睛，那是因为虹膜基质上方有一层额外的脂褐素。还有很少见的虹膜异色症，也就是说两只眼睛颜色不同，比如越狱主角米帅就是左眼浅褐色右眼绿色。这种现象最常见的原因是遗传。毕竟米帅就是复杂的混血关系啊。
然而，其他因素也会影响眼睛的颜色，比如炎症就可能导致眼睛变色。