集体土地的性质是不能办房产证的，因为不是个人产权的，是集体的产权。农村集体土地证能办理房产证，办理的是集体土地房屋所有权证书，是属于小产权，和国有土地上办理的国有土地房屋所有权证是不一样的。
房屋应当按照基本单元进行登记。房屋基本单元是指有固定界限、可以独立使用并且有明确、少有的编号（幢号、室号等）的房屋或者特定空间。集体土地范围内村民住房，以宅基地上独立建筑为基本单元进行登记；在共有宅基地上建造的村民住房，以套、间等有固定界限的部分为基本单元进行登记。
依法利用宅基地建造的村民住房和依法利用其他集体所有建设用地建造的房屋，可以依照本办法的规定申请房屋登记。因合法建造房屋申请房屋所有权初始登记的，备齐材料就可以申请了。