签订征地补偿协议的程序是：
1、市、县国土资源局在被征用土地所在地的村范围内发布征地通告，告知被征用土地的村集体经济组织;
2、市、县国土资源局会同被征地所在地的乡镇政府就征地通告的内容征询村集体经济组织和农民的意见;
3、市、县国土资源局会同被征用土地的所有权人、使用权人实地调查被征土地;
4、被征地农村集体经济组织应当就协议主要内容按照村民大会等民主程序作出决议;
5、村委会作为被征收主体的，签订协议后，农村集体经济组织或者村民委员会应当向农村村民公示征地补偿安置协议。
【法律依据】
根据《土地管理法》第四十七条，征收土地的，按照被征收土地的原用途给予补偿。征收耕地的补偿费用包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。