影响氧化磷酸化的主要因素有两种：
1、抑制剂的含量，抑制剂能阻断呼吸链某一部位电子传递，阻断氧化磷酸化中的氧化反应，进一步影响氧化磷酸化。
2、是否含有解偶联剂，解偶联剂可解除氧化和磷酸化的偶联过程，使电子传递照常进行而不生成能量。DN作用机制是作为载体将其运回线粒体内部，破坏质子梯度的形成。由电子传递产生的能量以热被释出。
氧化磷酸化是一个生物化学过程，在真核细胞的线粒体或细菌中，是物质在体内氧化时释放的能量供给与无机磷合成的偶联反应。有两种类型，一种是代谢物脱氢后，分子内部能量重新分布，使无机磷酸酯化先形成一个高能中间代谢物，这称为底物水平磷酸化。另一种是在呼吸链电子传递过程中偶联的生成，这就是氧化磷酸化。