小规模纳税人取得了增值税专用发票的话，就作为普通发票用来入帐就可以了，将抵扣联和发票联一起入作为备查，不能进行抵扣，这是为了以防对方增值税一般纳税人如果发现或被查出开错发票,到时会调查用。
根据《国家税务总局关于纳税人认定或登记为一般纳税人前进项税额抵扣问题的公告》(国家税务总局公告2015年第59号)的规定，纳税人自办理税务登记至认定或登记为一般纳税人期间，未取得生产经营收入，未按照销售额和征收率简易计算应纳税额申报缴纳增值税的，其在此期间取得的增值税扣税凭证，可以在认定或登记为一般纳税人后抵扣进项税额。