查摆剖析是开展“学整树”活动的关键环节，问题查的准不准，摆的实不实、剖的到不到位，析的见不见真功，直接影响着下一步的整改提高。第二阶段的查摆剖析，采取党组成员带分管科室的办法进行，做到“一抓、二查、三结合、四落实”。
一抓。就是党组成员新自抓，抓好分管科室的查摆剖析。对学习讨论情况做个小结，给查摆剖析做个安排，搞好动员，抓好查摆剖析第二阶段任务落实。
二查。就是各科室、二级机构都要按照职责，每名机关工作人员都要根据自己的角色定位，查找单位和个人存在的“庸懒散软”等作风问题。敢于亮相，严于解剖，分析思想根源，写出书面材料。
三结合。一是与开展谈心交流活动相结合。采取党组成员与分管科室、二级机构负责人谈，科室负责人与科室人员谈，同事之间谈等形式，谈心交心，帮助提高。党组成员组织分管科室汇报单位和个人查摆剖析情况，提高思想认识，开展批评与自我批评。做到边查边改，边整边改，切实转变工作作风，提高工作效能。二是与开展万人评议机关评议行风活动相结合。开展一事一评活动，在委办公楼大厅设立评议箱，接受办事单位和群众评议监督。开展群众评议活动，适时召开座谈会或发放社会调查问卷，接受群众、企业、机关（县区）的监督评议；适时召开全委群众大会，针对单位或个人存在的“庸懒散软”等问题进行评议。三是与开展点评剖析活动相结合。党组成员对分管单位，科室、二级机构负责人对科室人员存在“庸懒散软”问题进行一一点评，指出存在问题，查找剖析根源，明确努力方向。
四落实。一是时间要落实。查摆剖析阶段时间较长，同志们要根据分管工作，做好查摆剖析时间上的安排和保证。二是人员要落实。发改委工作头绪多、任务重每天都有这样那样的工作需要去落实、去协调，希望同志们做好计划，统筹安排，达到人人参于。三是内容要落实，查摆剖析时间长、内容多，活动办公室要拿个计划出来，按照计划一步一步的开展，决不走过场。四是效果要落实。突出自查、互查、领导点等活动重点，开展好批评和自我批评，务求开展“学整树”活动第二阶段查摆剖析工作的实效。